Dados do Trabalho

Título

Análise automatizada de genotipagem STR no monitoramento do quimerismo pós transplante alogênico de células tronco hematopoiéticas

Resumo

A análise de quimerismo por STR (short tandem repeats) é utilizada para monitorar o perfil genético da linhagem hematopoiética em pacientes com doenças neoplásicas hematológicas e doenças hematológicas não malignas, que foram submetidos ao transplante de células tronco hematopoiéticas (TCTH) alogênico. O quimerismo pós TCTH pode ser classificado como: quimerismo completo (QC), quando é detectado apenas o perfil genético do doador, quimerismo misto (QM) quando são detectados alelos do doador e receptor e falha de pega, quando é detectado apenas o perfil do receptor pós TCTH. STR são pequenas repetições em tandem dispersas no genoma humano, que determinam grande variabilidade entre os indivíduos. O monitoramento do quimerismo é realizado em amostras de DNA dos pacientes pós TCTH, através da amplificação simultânea de 24 loci de STR por PCR (reação em cadeia da polimerase) e eletroforese capilar. O objetivo foi monitorar e quantificar o quimerismo em amostras de DNA de pacientes pós TCTH. DNA de 241 pacientes PÓS-TCTH (doenças malignas e não malignas) foram analisados em comparação com o DNA PRÉ-TCTH e doador, utilizando o kit GlobalFiler®PCR, um painel multiplex de 24 loci de STR, sendo 21 autossômicos e 3 loci de cromossomos sexuais entre novembro de 2017 -junho de 2022. A eletroforese capilar foi realizada no Genetic Analyzer 3500®e os dados analisados de forma qualitativa e quantitativa com o software GeneMapperIDX1.4®. Foram considerados como informativos os casos que apresentaram no mínimo três loci, com perfil distinto entre receptor e doador. Foram investigados 241 pacientes, 77% (185) neoplasias hematológicas e 23% (56) de doenças não malignas. Foram analisadas 1241 amostras pós TCTH, com acompanhamento de 20 dias até 7 anos pós TCTH. No grupo das neoplasias, 87% (795) das amostras apresentaram QC, 12%(111) QM e menos de 1%(3), perfil do receptor pós TCTH. Nas doenças não malignas, 62% (206) apresentaram QC e 38%(126) QM. Nas 237 amostras com QM a quantificação variou de 1-98% de células do receptor, dessas 3% (38) foram identificadas em primeira avaliação pós TCTH e, 25 reverteram para QC. A análise por STR é considerado o padrão ouro para o monitoramento do quimerismo. A estratégia para acompanhamento pós TCTH, que é baseada em um painel utilizado para identificação humana, apresentou alta sensibilidade na identificação de perfis mistos, mesmo em baixas proporções, o que trouxe segurança para intervenções precoces no tratamento dos pacientes.

Área

Genética/ Terapia de precisão